リポジトリDBとの接続が切れた場合の対処法としてDBのタイムアウトの時間設定を変更します。
Yellowfinデータベースのタイムアウト設定を変更するには、Web.XMLファイルから行います。
このファイルは<Yellowfinディレクトリ> /appserver/webapps/ROOT/WEB-INFにあります。
下記4行のパラメータを追加してください。
<init-param>
<param-name>JDBCTimeout</param-name>
<param-value>1800</param-value>
</init-param>
3行目の「1800」は秒数です、これを変更すればタイムアウトの時間を変更することができます。
設定後、Yellowfinのサービスを再起動することで反映されます。